1779年6月，托马斯·杰斐逊当选为弗吉尼亚州州长。 同年，他在弗吉尼亚州议会上提出《关于进一步普及知识的法案》(Bill for the More General Diffusion of Knowledge)。
1780年，托马斯·杰斐逊连任了弗吉尼亚州州长。 同年，他将弗吉尼亚州州府由威廉斯堡市迁移至里士满。
1781年1月，英军入侵弗吉尼亚州，托马斯·杰斐逊命令民兵抗击英军侵略。6月，州长任期届满。12月，弗吉尼亚州议会表彰了托马斯·杰斐逊在州长任期内的政绩，而杰斐逊则开始撰写《弗吉尼亚纪事》。
1783年6月，托马斯·杰斐逊当选为国会议员。 期间，他向国会提交了一系列重要法案。
外交生涯
1784年5月，托马斯·杰斐逊与约翰·亚当斯、本杰明·富兰克林一起被任命为与欧洲各国签订友好通商条约的谈判代表。 9月，安排出版了《弗吉尼亚纪事》。
1785年5月，托马斯·杰斐逊被国会任命为美国驻法公使。
1786年3月，托马斯·杰斐逊赴伦敦会见约翰·亚当斯，5月返回巴黎。
1787年9月，托马斯·杰斐逊同意美国制宪会议通过联邦宪法。
1789年9月，托马斯·杰斐逊被提名为美国国务卿，随后他离开巴黎启程回国，于11月回到美国。
1790年3月，托马斯·杰斐逊当选为美国艺术与科学学院会员。4月21日，杰斐逊抵达纽约，出任美国第一任国务卿，组建了美国国务院。
1792年，托马斯·杰斐逊创立了"民主共和党"。
1793年1月4日，托马斯·杰斐逊当选为美国哲学学会副会长。12月，他辞去了国务卿职务。
总统任期
1794年1月，托马斯·杰斐逊回到了蒙蒂塞洛庄园。
1795年4月23日，托马斯·杰斐逊致信联邦众议员詹姆斯·麦迪逊，明确拒绝出任官职。
1796年12月，经各州选举投票，约翰·亚当斯当选为美国总统，托马斯·杰斐逊当选为副总统。
1797年3月，托马斯·杰斐逊当选为美国哲学学会zhuxi。3月4日，就任副总统。
1798年7月，托马斯·杰斐逊反对执政党联邦党通过的《客籍法》和《惩治叛乱法》。
1800年5月，托马斯·杰斐逊被提名为总统候选人。同年夏，着手改组威廉与玛丽学院。
1801年2月，托马斯·杰斐逊当选为美国第三任总统，阿伦·伯尔为副总统。3月，宣誓就任美国总统。12月，向国会提交第一个国会咨文。
1802年12月，托马斯·杰斐逊向国会提交第二个国会咨文。
1803年1月，托马斯·杰斐逊就派遣梅里韦瑟·刘易斯和威廉·克拉克组织西部探险一事向国会提出特别说明。5月，美法在巴黎签署《路易斯安那条约》，美国从法国手中购得路易斯安纳。7月，拟就购买路易斯安纳提出宪法修正案。10月，向国会提交第三个国会咨文。随后，《路易斯安那条约》得到参议院批准。
1804年12月，托马斯·杰斐逊再次当选为美国总统。
1805年3月4日，托马斯·杰斐逊宣誓就任美国总统。
1806年11月，托马斯·杰斐逊颁布逮捕前副总统阿伦·伯尔的公告。
1807年1月，托马斯·杰斐逊再次当选为美国哲学学会zhuxi。3月，签署禁止贩卖奴隶的法案。7月，颁布反对英国战舰的公告。12月，签署《禁运法》。
创建大学
1809年，蒙蒂塞洛庄园建成。 同年3月，托马斯·杰斐逊隐退，3月15日回到蒙蒂塞洛。
1811年1月，托马斯·杰斐逊为美国农业协会起草工作计划。
1814年，托马斯·杰斐逊把私人藏书7000册作价卖给美国国家图书馆。
1815年1月，托马斯·杰斐逊提出弗吉尼亚大学纲要。
1819年1月，弗吉尼亚议会通过创办弗吉尼亚大学决议。3月，托马斯·杰斐逊当选为弗吉尼亚大学校长，他亲自设计了第一批校舍，并派人去欧洲延聘教授，设法筹措经费。
1824年5月，弗吉尼亚大学建成开学。
1826年3月，托马斯·杰斐逊立下遗嘱。6月24日，谢绝了参加7月4日国庆的邀请。7月4日，托马斯·杰斐逊于蒙蒂塞洛去世，享年83岁。
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